A Pró-Reitoria de Pesquisa e Inovação (PROPES) é responsável pela política de desenvolvimento científico, tecnológico e Inovação no Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia Baiano (IF Baiano). Entre seus objetivos se incluem o apoio ao ensino em nível de Pós-Graduação Lato sensu e Stricto sensu, o fomento, a promoção e a realização de pesquisas básica e aplicada, com foco na integração entre docentes, estudantes e servidores no processo de construção multidisciplinar do conhecimento.