A formação no Ensino Médio do IF Baiano é voltada para o desenvolvimento de atividades profissionais. Pode ser complementar ou integrada à educação geral, de acordo com as seguintes formas de articulação:
Cursos Subsequentes
São cursos de educação profissional para quem já tem o certificado de conclusão do Ensino Médio. Trata-se de uma formação instrumental para adolescentes, jovens e adultos, aliando teoria e prática, que qualifica para gestão e mundo do trabalho. A duração varia de 1 a 2 anos.
Cursos Integrados
São cursos para quem concluiu o Ensino Fundamental. O estudante passa pela formação do currículo comum ao Ensino Médio e, ao mesmo tempo, realiza a formação Técnica e Profissional, ampliando as possibilidades de inserção no mundo do trabalho. A duração média é de 3 anos.